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耶鲁团队在研究中找到了保护遗传隐私的方法

Illustration - scrubbing computer data from DNA (Wendolyn Hill插图)

功能基因组学的时代使科学家能够分析疾病和健康中细胞活动的大量数据。实验室之间分享的数据越多,科学家发现与疾病相关的基因的能力就越大。

然而,这种功能基因组数据的广泛共享产生了一个难题,因为它也使个人的遗传隐私更难保护。

在一份新的报告中,耶鲁大学的一个科学家团队开发了一种方法来保护人们的私人基因信息,同时保留研究人员之间自由交换功能基因组数据的好处。

这份报告,11月12日发表在《细胞》杂志上,是由资深作者马克•格斯坦阿尔伯特·L·威廉姆斯教授生物医学信息学和分子生物物理学和生物化学教授,计算机科学,科学和统计和数据,和第一作者Gamze Gursoy,格斯坦的实验室的博士后研究员。

“基因信息是所有信息中最基本的,”格斯坦说。“如果有人获得了你的财务信息,你仍然可以获得一张新信用卡。但一旦基因组进入数据库,你就卡在那里了——你的子孙也是如此。”

Ancestry.com等基因检测服务的广泛使用,已经让个人能够识别他们不认识的亲属。然而,科学家收集的巨大基因数据库也可能被用于不那么有利的用途。

例如,一个怀有恶意并持有从咖啡杯中提取的DNA的人,如果这个人之前参加过一项关于艾滋病的研究,从理论上讲,他就可以确定他是否感染了艾滋病毒。除了潜在的敲诈威胁,人寿保险公司可以拒绝为该个人承保。类似的风险也存在于其他人身上,比如说,患癌症的高风险人群。

隐私风险跨越几代人。由于个人基因组数据永远不会被抹去,一位精神分裂症患者的孙子可能有一天会因为他遗传的患精神分裂症的基因倾向而面临歧视。

此外还有社会风险。例如,敌对的外国政府可以侵入数据库,寻找可能具有破坏性的美国公民基因信息。或者专制政府可以使用一些数据,比如在所谓的优生学项目中,来识别和伤害具有“不良特征”的个人。

“遗传学有一个有问题的历史,”格斯坦说。

为了克服这些隐私威胁,Gursoy和Gerstein开发了一种方法来量化研究中有多少数据可能“泄露”——或包含识别研究中个人的信息。然后,他们能够“消毒”或阻止访问少量个人可识别的遗传信息,同时保留绝大多数数据供研究人员使用。

格斯坦说:“我们可以在保护个人隐私的同时,仍然鼓励人们参与基因研究,这无疑对社会有益。”

新闻旨在传播有益信息,英文原版地址:https://news.yale.edu/2020/11/12/yale-team-finds-way-protect-genetic-privacy-research