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约翰霍普金斯大学新闻

Johns Hopkins biologist and computer scientist James Taylor dies at 40

约翰·霍普金斯大学生物学和计算机科学教授詹姆斯·泰勒于4月2日星期四去世。他是40。

James Taylor

图片说明:詹姆斯·泰勒

作为计算生物学和基因组学研究的开拓者,泰勒作为一名科学家、教师和同事,在克里格艺术与科学学院(Krieger School of Arts and Sciences)和惠廷工程学院(Whiting School of Engineering)任职,产生了很大的影响。他帮助开发了用于数据分析的银河平台,并与他的实验室成员一起扩展了该平台,使大规模的计算分析更容易获得和重现。他的研究还侧重于通过整合分析了解基因组和表观基因组对基因转录的调控,目的是全面了解基因组的结构和功能。他还制定了一项战略,通过检测巴尔的摩港的微生物并使用最新开发的便携式快速DNA测序技术持续监测微生物水平,来支持切萨皮克湾的健康。

生物系主任文斯·希尔瑟(Vince Hilser)把泰勒描述为生物系的基石。泰勒通过揭示他们所研究的蛋白质与其他有机体的蛋白质之间的相似性,帮助其他教员发现了新的见解。

“他在2014年来到这里,这是一次转变,”Hilser说。“他是变革的催化剂,产生了巨大的积极影响。”

生物学助理教授拉吉夫·麦考伊(Rajiv McCoy)说,他把泰勒视为导师和朋友。

“他为生物系的计算机研究开辟了一条道路,这也是我来霍普金斯大学的主要原因之一,”麦考伊说。“詹姆斯是学员和初级教员的无私倡导者,不知疲倦地在幕后为我们工作。詹姆斯也是计算研究中再现性的直言不讳的支持者。他强调这一问题并开发解决这一问题的工具的工作对科学界来说是无价的。”

生物学副教授约翰·金(John Kim)和泰勒在本科生教学实验室共用相邻的办公室和实验室。

“他的办公室大门总是敞开着,邀请任何人进来交谈,”金说。他布置得很少,中间只放了一张小圆桌,靠窗的扬声器里放着各式各样的音乐,而他则在笔记本电脑上工作。这是一个开放、诱人的空间,我和许多人会在这里停下来谈论科学,或只是打个招呼。他是个很好的倾听者,对自己的时间考虑周到,慷慨大方。我们失去了一位杰出的科学家和一位伟大的朋友,但他感动了许多人,使他们的生活变得更好。”

泰勒是“一位杰出的科学家、同事、导师和社区建设者,”彭博社杰出的计算机科学和生物学副教授迈克尔·沙茨(Michael Schatz)说。

“他的影响是不可估量的,成千上万的科学家从他的领导和贡献中受益,”Schatz说。“就个人而言,詹姆斯一直都很善良、友好、慷慨,我们会非常想念他的。”

泰勒2000年在佛蒙特大学获得计算机科学学士学位,2006年在宾夕法尼亚州立大学获得计算机科学博士学位,在那里他参与了几个脊椎动物基因组项目和编码项目。在进入约翰霍普金斯大学之前,他曾于2008年至2013年在埃默里大学(Emory University)生物学系、数学系和计算机科学系担任副教授。

2014年至2016年,他是美国国家基因组分析中心科学顾问委员会的成员;2013 – 2016年iPlant科学顾问委员会委员;2012 – 2014年担任XSEDE项目用户咨询委员会委员;2011年担任国际阿拉伯数据联盟:工程、建筑和基础设施工作组联合主席。

他的妻子梅雷迪思·格雷夫(Meredith Greif)是社会学系的助理教授,他的遗骨还在。

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写在纪念册和讣告上

新闻旨在传播有益信息,英文原版地址:https://hub.jhu.edu/2020/04/03/james-taylor-obituary-tribute/