加州大学洛杉矶分校的计算机科学家和他们的合作者设计了一个使用云计算和大数据分析的计划，使发展中国家的科学家能够启动生物信息学研究项目。
生物信息学是对生物数据的计算分析。这一新兴领域的研究在疾病诊断、治疗和预防传播方面具有广泛的应用;以及发展公共卫生战略和新药。该小组的建议发表在《自然生物技术》杂志上。科学家们还创建了一个在线教育资源指南。
“一台电脑和高速互联网连接是良好的生物信息学研究所需的所有基础设施，而这些资源通常已经在低收入国家的大学里，”该研究的合著者、加州大学洛杉矶分校计算机科学博士后学者Serghei Mangul说，他专门研究生物科学。
曼古尔说，这项投资比建造一个最先进的生命科学实验室要便宜得多。因为化学药品和液体被使用和分析。这些设施的建设和维护成本可能从数十万美元开始。他补充说，还需要考虑安全法规和政策问题。
一个启动的生物信息学程序不一定要收集数据。
“基因组学和相关领域已经有很多公开的数据，这些数据可以产生与当地相关的有影响力的见解，”Mangul说。
他说，例如，对热带国家的现有生物信息学研究可能导致预防疟疾、登革热、恰加斯病和这些地区流行的其他疾病传播的新方法。此外，先前发表的生物信息学数据可能会提供更多关于“第二关”的见解，训练有素的生物信息学研究人员就能做到这一点。
“我真的相信对数据的二次分析;这和第一次传球一样重要。”赛义德·曼古尔(said Mangul)是加州大学洛杉矶分校(UCLA)定量和计算生物科学研究所(Institute for Quantitative and Computational Biosciences)合作实验室的研究员。
曼古尔在东欧中低收入国家摩尔多瓦出生和长大。他来美国攻读博士学位。他说，帮助发展中国家，比如他自己的国家，对他来说是一种特别的激情。
这项研究的另一位合作者、加州大学洛杉矶分校研究所(UCLA institute)的项目经理拉娜·马丁(Lana Martin)也是如此。她说，研究这个想法的部分动机是在德克萨斯州的低收入地区长大，部分原因是在加州大学洛杉矶分校(UCLA)完成人类学博士学位期间，曾在巴拿马进行实地研究。
“这些地区已经有了优秀的科学家，他们只需要接受一些培训，就能迅速掌握最新的数据分析技术，”马丁说。
他们的在线教育资源指南，可在软件平台网站GitHub上获得，包括生物信息学代码和数据集的例子，以及访问数据集的方法;以及基于云计算的资源。Mangul和Martin正与他们在巴拿马的一位共同作者合作，在那里建立一个强大的生物信息学研究项目。
研究人员计划开发大学级别的课程，并建立一个网络平台来连接世界各地的生物信息学科学家。
“未来几年，对生物信息学数据分析的需求将会更大，”马丁说。“考虑到这一点，我们相信，建立一个具有统一平台和材料的全球生物信息学培训和支持联盟，将鼓励低收入国家和机构的科学家参与尖端的、更重要的是，对当地有益的STEM研究。”
“最终，这将提高国内科研和出版的生产力，”她补充道。
加州大学洛杉矶分校计算机科学和人类遗传学教授埃利亚扎·埃斯金(Eleazar Eskin)也是这篇论文的作者之一。其他作者分别来自约翰霍普金斯大学、巴拿马科技大学、乔治华盛顿大学医学与健康科学学院和加州大学圣地亚哥分校。
这项研究主要由美国国立卫生研究院(National Institutes of Health)资助，另外还有美国国家科学基金会(National Science Foundation)和其他教育和科学组织的支持。
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