基因组学测序中心整体支持顶级研究

想象一下，如果学术界有奥斯卡奖，特别是那些推动研究进步的幕后无名英雄。

在这种情况下，信封中的获胜名称可能是基因组学测序中心，以表彰其在小组研究中的最佳支持作用。

作为弗拉林生命科学研究所核心研究设施的一部分，基因组学测序中心是一个提供全方位服务的测序中心，提供快速且具有成本效益的基因组数据收集。该中心位于Steger Hall，提供一系列质量控制设备，以确定用户样品的完整性和浓度。

“我们来这里是为了支持我们教师的研究目标，”过去14年在该中心工作的实验室经理梅根·纳夫（Megan Naff）说。在这段时间里，纳夫见证了技术的巨大变化。

“我们在更短的时间内产生了成倍增加的数据，”纳夫说。“我们也看到测序的应用扩展到许多其他学科。

目前，基因组学测序中心对不同测序技术的应用跨越多个部门、学科和应用，包括人类健康、植物科学、动物健康、昆虫学和工程学。它保持着扩展到新学科的眼光。

作为一个小而强大的团队，该团队由四位技术娴熟的分子生物学家组成，他们使用最新的下一代测序技术。

“我们专注于定制项目，以满足校园调查人员的需求，”纳夫说。

就像导演在片场所做的那样，纳夫每天从晨会开始，讨论当前的项目以及团队成员如何才能最好地合作，同时坚持自己的剧本。

认识演员

该中心提供的三项服务之一是由 Jenny Jenrette 和 Riley Leathem 领导的下一代测序。它们共同处理 DNA 和 RNA 样本以生成全基因组 DNA、转录组和扩增子序列，后者是一种高度靶向的方法，使研究人员能够分析特定基因组区域的遗传变异。

他们的测序工作有助于推动研究生布莱克·考德威尔（Blake Caldwell）发现细胞先天免疫记忆中的DNA转变，这可能有助于对抗人类最致命的敌人之一 – 败血症。考德威尔的突破最近发表在《细胞报告》杂志上。

作为一名本科生，Leathem 开始在该中心兼职工作，并于 2023 年 5 月毕业后被全职聘用。她说，她喜欢与研究人员合作，提供定制体验并取得最佳结果。

“因为我们个性化项目，我们能够与每个客户密切合作，”Leathem说。“这为研究生提供了一个提出问题和接受指导的机会。

该界面还为研究生提供了进一步了解其具体项目和目标的机会。Jenrette说，这些观众是他们的工作对学生进行从DNA和RNA提取方法到输入和输出的质量控制分析等各个方面的培训方面影响最大的地方。

虽然他们的名字可能没有出现在灯光或帐篷上，但该中心的工作人员对他们为推进研究所做的贡献感到非常自豪。举个最近的例子，Jenrette与鱼类和野生动物保护部的Emmanuel Frimpong和Eric Hallerman合作，对三种当地鲦鱼的肠道内容物进行了测序。

灯光、相机、分析

基因组学测序中心提供的另外两项服务是 Sanger 测序和质量控制服务，这两项服务都在 Kris Lee 的指导下进行。Lee 在该中心工作了 20 年，在弗吉尼亚理工大学工作了 36 年。

Sanger测序的基本形式是一种产生有关DNA片段中四个核苷酸碱基的身份和顺序的信息的方法。它通常用于较小规模的项目和下一代测序结果的验证。

就每日产量而言，Lee 接收、运行和处理弗吉尼亚理工大学调查人员和外部实体收到的样本。在设置Sanger样品后，她处理任何要求的RNA或DNA质量控制测定，这是分析物质以确定其组成或质量的过程。

在 2023 财年，运行了近 15,500 个样本，为 110 名弗吉尼亚理工大学调查人员和外部客户提供支持。

Lee知道，作为一个成本回收实验室，基因组学测序中心很难与同样提供Sanger测序服务的商业供应商竞争。

“我相信提供更好的个人服务对于保持我们的研究快乐很重要，”李说。

更多信息可以在基因组学测序中心网站上找到。