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佛罗里达大学新闻

Triple Gator 毕业生 Matthew Diller 追求他在生物医学信息学方面的使命

<p>Matthew Diller</p>

马修·迪勒

找到完美的职业道路并不总是那么容易,尤其是当你是一个像马修·迪勒这样好奇心强、头脑过度活跃的学生时。

这位现任UF博士毕业生在本科时就充满了对科学的好奇心,但他经常努力将自己的学术兴趣(从哲学到神经科学)引导到一个领域。直到他发现了生物医学信息学这个无穷无尽的迷人世界。

不到十年前,这在用友还是一个新概念。一个研究生课程刚刚兴起,它结合了迪勒喜欢的一切——数据科学、人工智能、医学、哲学和信息技术。生物医学信息学是关于理解医疗保健行业每天产生的大量数据,以促进医学突破和改善公共卫生。Diller 认为自己使用数据来真正帮助人们过上更好的生活,他知道这是适合他的领域。

因此,他于2016年加入了第一批硕士课程,并于5月2日毕业,获得医学博士学位,主修生物医学信息学。从那以后,许多学生都遵循了迪勒的轨迹,今天,医学院的健康结果和生物医学信息学系有49名在校研究生和187个研究项目正在进行中。

“我只是爱上了这个领域,”迪勒说,他已经接受了美国国立卫生研究院博士后实习生的著名职位,他将在国家医学图书馆的科学主任下工作。“我喜欢看数据,以及它与一个人的健康有什么关系。这个领域是关于我们如何利用数据和计算机来解决现实世界的生物医学问题。

导师制的魔力

Diller 于 2010 年从他的家乡佛罗里达州西棕榈滩首次来到 UF,当时他正在文理学院攻读哲学学士学位,当时他的生活突然发生了变化。

“完全是偶然的,我最终遇到了我的导师比尔·霍根博士,当时我在 2014 年担任学生助理,就在我获得学士学位之前,”迪勒说。“他问我是否有兴趣了解他所做的研究,这是医学、哲学和人工智能的交叉点。在与他见过几次面后,我决定更多地了解生物医学信息学和他正在使用的这些语义网络技术。

Hogan 目前是威斯康星医学院 Mary T. 和 Ted D. Kellner 数据科学主席,当时是 UF 生物医学信息学部的主任。

“马特开始与我合作,完成我的一项赠款;我们正在为传染病流行病学模型的初始化和输出建立数据标准。马特是一个了不起的学生,我很欣赏他为工作带来的热情,“霍根说。“马特即将毕业,他的论文令人印象深刻,他将继续获得博士后奖学金,为我最亲爱的同事之一工作。

霍根认为,生物医学信息学领域可以为学生和世界带来变革。

“这仍然是一个年轻的领域,我们正在弄清楚很多事情,但当你看到临床护理中的电子健康记录以及它们为研究生成的数据量时,它已经改变了世界,”霍根说。

真实世界的解决方案

迪勒的博士论文就是这种有影响力的、有用的研究的一个例子。题为“一种基于本体的语义数据集成方法,用于暴露组研究,重点关注外部环境暴露和时间关系”,它基本上是关于Diller如何建立一个数据库,公共卫生研究人员可以使用它来保持患者更安全、更健康。

Diller从现有数据集(由美国环境保护署、美国邮政局和国家海洋和大气协会等组织发布)中提取有关环境因素的信息,并按位置和时间段将它们连接起来。

“我的数据库有气象数据、犯罪统计数据、社区步行信息——每个数据都来自单独的数据集,但转换为统一的格式并存储,”迪勒说。“例如,我有一个佛罗里达州阿拉楚阿县的代表,显示了该地区的一氧化碳水平,以及我住在盖恩斯维尔的小社区的步行性。我正在研究数据以及它与一个人的健康有何关系。我正在做的是为数据添加更多信息,以帮助人们确定他们是否可以将其用于自己的生活。

Diller的导师们看到了像这样的数据库以及像他这样有思想的研究人员的巨大潜力。

“Matt致力于推进基于本体的语义数据集成,用于暴露组研究是值得称赞的,”UF生物医学信息学项目部门主任江 Bian博士说。“我们热切期待他在未来几年继续为该领域做出贡献。

对于Diller来说,偶然发现生物医学信息学是一次偶然而充实的冒险。

“我从没想过会找到这个领域。我在本科时很挣扎,我发现课程有时有点让人不知所措,“迪勒说。“但后来我发现了这一点。我非常感谢我在那个研究实验室与霍根博士所做的工作,为我指明了这个方向。我真的很喜欢我正在做的事情。

艾比·温加滕 2024 年 4 月 26 日

新闻旨在传播有益信息,英文版原文来自https://news.ufl.edu/2024/04/matthew-diller/