表观基因组在癌症中的作用在新研究中揭示

几十年来，科学家们一直在对许多癌症类型的DNA进行测序，识别遗传密码中的错误，以帮助了解肿瘤的形成、它们如何生长以及导致其扩散的原因。但有时癌症是由遗传密码执行方式的微妙变化驱动的，而不是由密码本身的错误驱动的。这一层调控称为表观基因组。

在圣路易斯华盛顿大学医学院的科学家领导的新研究中，研究人员深入研究了11种癌症类型的表观基因组的工作原理，并揭示了基因组的这种调控系统在癌症形成、生长和扩散过程中的重要作用。

该研究于11月1日发表在《自然》杂志上，由共同资深作者、David English Smith杰出医学教授Li Ding博士领导;Ryan C. Fields，医学博士，博士，Kim 和 Tim Eberlein 杰出教授;以及华盛顿大学医学教授陈峰博士;普林斯顿大学的Benjamin J. Rachael博士。

“了解从正常细胞到肿瘤细胞以及从肿瘤细胞到转移性癌症的转变对于癌症预防和治疗非常重要，”丁说，他也是巴恩斯犹太医院和华盛顿大学医学院Siteman癌症中心的研究成员。

菲尔兹补充说：“这些癌症的表观遗传驱动因素可能有助于解释没有基因突变的肿瘤如何仍然具有侵略性，尽管我们预测了什么。菲尔兹是一名外科肿瘤学家，在Siteman治疗患者。

研究人员发现，正常细胞和肿瘤细胞之间的表观遗传差异在于基因组的“开放”程度，这决定了基因是否活跃以及活跃程度。癌细胞往往比正常细胞更开放。

研究小组发现了与癌症发生相关的特定表观遗传驱动因素，以及与转移性癌症相关的不同驱动因素，转移性癌症发生在肿瘤扩散到全身时。研究人员还发现有证据表明，癌症的表观遗传驱动因素可以与癌症形成和扩散中的DNA突变合作。一些驱动因素存在于多种肿瘤类型中，而另一些驱动因素仅针对某些癌症。

“这项研究为研究界提供了丰富的信息，”Chen说，他也是Siteman的研究成员。“这将为探索以前未报道的基因调控机制提供新的机会。

该研究的共同第一作者是华盛顿大学博士后研究员Nadezhda V. Terekhanova博士;阿拉·卡尔波娃（Alla Karpova），丁氏实验室的博士生;梁文伟博士，前华盛顿大学研究生和博士后研究员，现在是纽约基因组中心的博士后研究员。

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Terekhanova NV， Karpova A， Liang W， Strzalkowski A， Chen S， Li Y， Southard-Smith AN， Iglesia MD， Wendl MC， Jayasinghe RG， Liu J， Song Y， Cao S， Houston A， Liu X， Wyczalkowski MA， Jui-Hsien Lu R， Caravan W， Shinkle A， Naser Al Deen N， Herndon JM， Mudd J， Ma C， Sarkar H， Sato K， Ibrahim OM， Mo C， Chasnoff SE， Porta-Pardo E， Held JM， Pachynski R， Schwarz JK， Gillanders WE， Kim AH， Vij R， DiPersio JF， Puram SV， Chheda M， Fuh KC， DeNardo DG， Fields RC， Chen F， Raphael BJ， Ding L. 11 种肿瘤类型癌症转化期间的表观遗传调控。自然界。11月 1， 2023.

这项工作得到了美国国立卫生研究院（NIH）的支持，资助号为U2CCA233303、U54AG075934、U24CA210972、R01HG009711、R01CA260112、U24CA248453和NHGRI T32 HG000045。内容完全由作者负责，并不一定代表NIH的官方观点。

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