加州大学圣地亚哥分校和西奈山获得8.5亿美元的NIH数据集成中心奖

“这是一个独特的机会，使生物医学研究人员能够通过充分利用美国国立卫生研究院在NIH共同基金的支持下进行的大量投资中出现的数据来做出创新发现，”加州大学圣地亚哥分校教授兼CFDE数据资源中心首席研究员Shankar Subramaniam说。Subramaniam是Joan和Irwin捐赠的生物工程和系统生物学主席，是加州大学圣地亚哥分校生物工程，生物信息学和系统生物学，计算机科学与工程，细胞与分子医学以及纳米工程的杰出教授。Subramaniam在建立NIH资助的国家数据基础设施方面有着悠久的记录。他目前是NIH共同基金代谢组学项目的PI，也是NIH指定的国家数据工作顾问，包括TOPMED和NPH。

“通过整合来自各种组学技术的数据，并使这些数据集随时可用于人工智能和机器学习的分析和可视化，可以出现许多发现，”CFDE数据资源中心首席研究员，西奈山生物信息学中心主任，药理学教授Avi Ma’ayan教授说，人工智能和人类健康。“我们很高兴NIH认可了我们过去对CFDE，基于细胞的集成签名库（LINCS）和照亮可成药基因组（IDG）共同基金计划的贡献，并相信我们将领导这项新的努力。

目前，大多数共同基金数据集分散在不同的数据门户中，由于缺乏标准化的社区做法和共享的数据处理协议，导致利用不足。通过跨共同基金数据无缝发现数据集，统一处理数据，并更好地组合来自不同程序的数据，研究人员预计会出现协同发现。

通过与共同基金数据协调中心合作，数据资源中心和知识中心有望为整个生物医学研究领域提供非常有价值的计算资源。

“例如，通过整合来自共同基金计划，国家代谢组学数据库，MoTrPAC，精准健康营养和人类健康暴露分析研究的代谢组学数据，我们有一个独特的机会来绘制人类在饮食，运动和环境扰动下的’代谢型’，”Subramaniam说。

Subramaniam教授和Ma’ayan教授将领导数据资源中心。知识中心奖将由 哈佛医学院和波士顿儿童医院遗传学和基因组学系儿科助理教授Jason Flannick领导，以及Broad研究所的准成员以及Broad研究所糖尿病研究和知识门户计划主任Noel Burtt博士和Kyle Gaulton， 加州大学圣地亚哥分校健康中心儿科副教授。

Subramaniam教授担任共同基金代谢组学计划的首席研究员。Ma’ayan教授曾担任共同基金数据协调中心：LINCS和IDG计划的首席研究员。基于这一经验，研究团队的工作将涉及：

• 建立数据资源门户，以便方便用户查询共同基金数据集
• 为生态系统、住房信息以及相关资源、培训和活动的链接开发 CFDE 门户
• 协助共同基金计划标准化生态系统中元数据，数据和数字资源的处理方式，并 与其他相关的NIH工作联络

加州大学圣地亚哥分校是加州前五名（第 4^名）由 NIH 资助的机构之一，在全国排名第 12 ^位。

 这项工作得到了NIH主任办公室的支持（奖励编号OT2OD036435）。

此版本基于西奈山伊坎医学院的发布。

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关于加州大学圣地亚哥分校的生物信息学、系统生物学和生物医学数据科学

加州大学圣地亚哥分校是生物信息学、系统生物学和生物医学数据科学领域的领导者。加州大学圣地亚哥分校生物信息学和系统生物学计划由Shankar Subramaniam教授创立，是该国排名第一的项目，已经培养了数百名工业和学术界的研究领导者。生物信息学研究生课程由NIH培训补助金支持超过20年。加州大学圣地亚哥分校的圣地亚哥超级计算机中心是大型国家存储库的神经中枢，包括几个NIH资助的数据资源。

关于加州大学圣地亚哥分校的生物工程

加州大学圣地亚哥分校生物工程系在生物医学/生物工程方面排名全国第 5（美国新闻与世界报道最佳工程学校排名，2023 年 4 月发布）。二十多年来，生物工程每年都跻身全国前五名。在加州大学圣地亚哥分校，工程、医学和健康科学之间的合作是这一成功的基础，它提供了一个理想的研究和培训环境，使工程师和医学科学家之间的有效合作成为可能。研究兴趣大致分为生物工程的三大支柱：多尺度生物工程，组织工程和再生医学以及系统生物学和医学。该系拥有成熟且有前途的核心教师，拥有四个疾病重点领域：癌症、心血管疾病、代谢紊乱和神经退行性疾病。2022年，该系被命名为舒谦-基因莱生物工程系，以表彰吉恩·莱的慷慨。