当人类看到自己的孩子吃不应该吃的东西时,我们可以简单地告诉他们:“别吃那个。”它会让你生病的。”那些听从这个建议的人,就不会有自己学习这个教训的痛苦经历。虽然其他动物不能让它们的后代坐下来好好谈一谈,但这并不意味着它们不能指导后代了解潜在的危害。
例如,微小的蛔虫秀丽隐杆线虫以铜绿假单胞菌为食。然而,某些环境条件可能导致P。铜绿假单胞菌改变成致病性的,也就是说,它会使吃它的蠕虫生病。2019年,墨菲实验室的研究人员发现,当蠕虫母亲因P。绿脓杆菌,它们学会避开这种细菌。不仅如此,它们的后代,一直到它们的曾曾孙,不知何故也知道要避开这种细菌。然而,在四代之后,跨代回避行为消失了,让蠕虫再次以细菌为食。
对秀丽隐杆线虫的深入研究,使我们不仅了解了其体内每个细胞的身份(如神经元、肌肉细胞、肠细胞等),还了解了其在胚胎发育过程中出现的顺序。尽管如此,蛔虫仍然会以复杂的行为让我们惊讶,比如跨越世代的回避。是什么导致了这种行为?Murphy实验室的初步研究表明,其他类型的致病菌不会导致后代产生回避行为,这表明这种行为是特定于致病性P。绿脓杆菌。此外,研究人员发现,避免致病性P。绿脓杆菌是由一种特殊的蠕虫神经元控制的。但是关于这一现象的几个问题仍然存在,所以研究小组继续调查。
“我们想知道蠕虫是如何知道它们所吃细菌的身份的,”分子生物学教授Coleen Murphy说。她是路易斯-西格勒综合基因组学研究所(LSI)的教授,同时也是《自然》杂志上详细介绍该团队发现的一篇论文的资深作者。
为了研究这个问题,墨菲实验室的两名研究人员——副研究员雷切尔·卡雷茨基(Rachel Kaletsky)和研究生丽贝卡·摩尔(Rebecca Moore)——用一种无害细菌喂给蠕虫,这种细菌中加入了从致病性P。绿脓杆菌。这些物质包括细菌代谢过程中所涉及的物质,以及细菌遗传物质。后者由三种分子组成:DNA,它可以被认为是一本食谱,包含了生物体生存所需的所有蛋白质的食谱;信使rna,它是单个食谱的拷贝,被读出来构建蛋白质;和小rna,它们不编码蛋白质,而是在细胞中执行调节功能,通常通过促进信使rna的破坏。
墨菲说:“与我们最初预期的不同,我们发现蠕虫‘读取’了细菌产生的小rna,尤其是与细菌致病状态相关的小rna。”事实上,研究人员发现,遗传回避行为需要一种叫做P11的特殊细菌小RNA。
“Geoff Vrla在Zemer Gitai实验室对细菌的研究对于证明关键的小RNA是P11至关重要,”Murphy说。吉塔伊是普林斯顿大学埃德温·格兰特·康克林生物学教授。
墨菲补充说:“P11小RNA本身甚至不会使蠕虫生病——仅仅检测P11的存在就足以使蠕虫避开细菌,并将其传递给四代后代。”
卡雷茨基、摩尔和他们的同事发现,一旦蠕虫吃了这种细菌,P11就会被蠕虫的肠道吸收和处理,然后进入蠕虫的卵子和精子。(秀丽隐杆线虫的母亲是雌雄同体的,因此它们拥有两种类型的生殖细胞,可以自我受精。)从那里,P11被传递到控制母亲回避行为的神经元,在那里导致蠕虫信使rna的破坏,这种rna编码一种叫做macoilin的蛋白质。信使rna的缺失阻止了这种蛋白质的生成,而这反过来又使蠕虫避开了致病菌。P11在蠕虫生殖细胞中的存在也确保了它可以被后代的蠕虫使用。
墨菲说:“据我们所知,这是第一次发现动物宿主‘阅读’病原体的小RNA,并进化出一种反应,帮助它保持健康,这是一种新生的适应性免疫系统反应。”
“只有几个例子这样的跨物种通过小RNA分子沟通,和更少的例子适应性继代行为变化小RNA,”朱莉Claycomb说,加拿大研究主席在多伦多大学的小RNA生物,他并没有参与这项工作。
“这项研究为理解控制这种现象的分子机制设定了一个高标准,并开辟了一个新的研究领域,”Claycomb补充道。
由Rachel Kaletsky, Rebecca S. Moore, Geoffrey D. Vrla, Lance R. Parsons, Zemer Gitai和Coleen T. Murphy合著的《线虫解释细菌非编码rna以学习致病规避》发表在9月9日的《自然》杂志上。这项工作得到了先驱奖(NIGMS DP1GM119167)、格伦医学研究基金会(GMFR CNV1001899)和HHMI-Simons学者计划(AWD1005048)的支持。R.S.M.和G.D.V.得到了T32GM007388 (NIGMS)的支持,z.g则获得了先锋奖(DP1A1124669)。
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