为潜在的COVID-19治疗识别现有药物的新方法

密歇根州东兰辛。mdash;1月下旬，当全世界越来越不安地关注着covid19的流行时，密歇根州立大学(Michigan State University)的一个实验室改变了方向，以应对即将到来的挑战。该实验室的专长是利用人工智能和大数据来发现癌症疗法。

陈实验室在小儿科和人类发展系、药理学和毒理学系助理教授陈斌的带领下，发挥了自己的专长。他们开发了一种计算程序来识别现有的药物，这些药物可以在不需要接触SARS-CoV-2病毒的情况下被重新用于对抗SARS-CoV-2病毒。

当病毒感染人类细胞时，它就劫持了复制和生存的生殖能力。在此过程中，病毒会干扰宿主细胞基因的活动。每一种病毒在感染的某一时刻都会在细胞上留下独特的印记。科学上称为基因表达特征;这是现代实验室技术可以检测到的。

我们想找到一种药物，可以阻止宿主细胞的基因表达变化，希望减轻疾病的进展和减轻症状。陈先生说。

他说，与此同时，世界各地的科学家对这种新病毒几乎一无所知，获得活病毒样本的机会充其量是有限的。根据一些公开的数据集，陈和他的团队推测冠状病毒家族的其他成员;非典和中东呼吸综合征;可以近似得到新病毒的基因表达特征。

利用fda批准或临床研究药物的现有文库和已建立的药物预测管道，研究小组通过一种复杂的方法对数千种可能的候选药物进行评分、评级和排序，以对照已知的基因表达特征。

幸运的是，我们发现了一些可能有效的药物。陈先生说。但我们需要做得更多。我们需要生物验证。

陈与德克萨斯大学医学分部的研究人员合作，在一种非洲绿猴的肾脏细胞上测试了排名最高的候选药物，这种细胞是毒理学和病毒学研究中常用的细胞系。首先用这种药物治疗这些细胞，然后感染新的SARS-CoV-2病毒。

我们给他们发送了10种药物，结果发现有4种药物能够预防病毒诱导的效应。陈先生说。不幸的是，用于治疗癌症的药物也有相当大的毒性。但是这个概念起作用了。我们的工作过程。我们现在可以找到更多可能的药物来逆转病毒的影响，并把那些毒性较小的药物留作进一步研究。

我非常欣赏科学界的开放态度。陈先生说。一开始我们知道的很少，但是科学家们已经把他们的工作成果提供给社区，这样我们就可以采取行动了。

韩国的研究人员对35种fda批准的抗病毒药物与实际的SARS-CoV-2样本进行了测试。14种阳性药物与陈氏实验室的筛选文库重叠，也被方法学高度评价。这些数据也从外部验证了陈发现过程的预测能力。

我们正努力用最好的科学来帮助病人。陈先生说。

他打算立即提供他们的工作。我们需要向公众公布这些数据。世界各地的其他实验室也许能从我们的工作中学到东西。陈先生说。他们可以选择新的化合物进行研究。有太多的药物需要筛选。我们无法独自测试所有的挑战。

本研究通过逆转感染宿主基因的表达，确定了covid -19的候选药物。出现在bioRxiv。请注意，这项研究与全球大流行期间共享的许多预印本档案(如bioRxiv)一样，没有经过同行审查。

共同领导这项研究的是陈实验室的两位博士后研究员Jing Xing和Rama Shankar。