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Scientists unwind mystery behind DNA replication

生命分子被扭曲了。但是,那些熟悉的DNA双螺旋链是如何在没有缠绕的情况下成功复制的,这就很难解释了。康奈尔大学物理学家的新观点有助于解开这个谜团。

染色质纤维和DNA复制过程中拓扑异构酶II的例证。

研究人员从拓扑的角度来解决这个问题,问什么影响螺旋形状本身对DNA复制。利用真核生物——构成绝大多数生物的生物——作为他们的模型系统,他们发现染色质(一种DNA和蛋白质的复合物)的内在机械特性决定了染色质纤维如何缠绕。

这种结构对新复制的DNA的成功分离至关重要:如果纤维过早地缠绕得太紧,那么在细胞分裂过程中分子就不能正确地分离。

“这项研究突出了基本生物过程中物理原理的重要性,”该研究的第一作者、霍华德·休斯医学研究所研究员、艺术与科学学院的物理学教授米歇尔·王说。

这篇题为“染色质扭转力学与拓扑异构酶活性的协同协调”的论文发表在10月17日的《细胞》杂志上。

在DNA复制过程中,当一个复制体分裂两条DNA链并向前移动时,DNA也必须绕螺旋轴旋转。这使DNA承受了很大的扭转压力,从而导致DNA发生额外的扭曲。

问题是:额外的扭曲会去哪里?如果额外的扭曲只发生在复制体的前面,那么两个子DNA分子就不会纠缠在一起,这样它们就可以分离了。然而,如果额外的扭曲进入了复制体的后部,那么两个子DNA分子就会纠缠在一起,无法分离。这将在细胞分裂过程中造成染色体分离的主要问题,可能导致DNA损伤并导致细胞死亡或癌症。

研究人员发现,扭转单一的染色质纤维比扭转双纤维容易得多。这意味着,额外的扭曲会优先出现在前面,从而最小化两个子DNA分子的纠缠。

“虽然染色质通常被认为是复制的障碍,”王说,“我们的结果表明,染色质也简化了复制拓扑结构,从而促进了复制动力学。”我们认为这是相当了不起的。”

在另一项实验中,研究人员发现一种分解DNA的酶(拓扑异构酶II)更喜欢前面的单一染色质纤维。染色质机制和拓扑异构酶活性似乎以一种协同的方式协调,以减少子链的缠绕。

为了了解染色质的机械行为,研究人员必须创造新的方法来处理它。由于任务的复杂性,以前从未尝试过用编织染色质纤维来制作基质。Wang和她的团队使用了她的团队之前开发的angular光学陷阱工具,以及其他方法来创建和处理单个和编织的染色质纤维衬底,使他们能够检查它们的扭转力学性能。

论文的合著者包括来自原子和固体物理实验室的博士后同事佟乐、高翔和杰西卡·基利安;研究专家詹姆斯·英曼;研究生Seong ha Park, Jaeyoon Lee和Ryan Badman;约翰霍普金斯大学医学院的乔伊斯·李和詹姆斯·伯杰。

石英圆柱的制造是在康奈尔纳米科技设施进行的,该设施是国家纳米技术协调基础设施的成员之一,由国家科学基金会资助。

琳达·格拉泽(Linda B. Glaser)是文理学院的新闻与媒体关系经理。

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新闻旨在传播有益信息,英文原版地址:http://news.cornell.edu/stories/2019/10/scientists-unwind-mystery-behind-dna-replication