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加州大学圣地亚哥分校新闻

著名的加州大学圣地亚哥分校微生物组先驱 Rob Knight 当选为美国国家工程院院士

加州大学圣地亚哥分校教授、微生物在人类健康和疾病以及生态系统功能中的作用研究的国际领导者罗伯·奈特(Rob Knight)被选为美国国家工程院院士,这是对工程师和计算机科学家的最高专业认可。2024 年 2 月 6 日,美国国家工程院表彰了 Knight 的开创性领导能力,并表彰了他“了解微生物组及其在医疗保健和可持续发展中的应用”。

奈特的职业生涯致力于微生物组的研究,微生物组是生活在环境和人体中的微生物。他的研究与广泛的实际应用相关,他在校园里的隶属关系反映了他工作深厚的跨学科性质。奈特是加州大学圣地亚哥分校医学院儿科系的教授;他是加州大学圣地亚哥分校雅各布斯工程学院 Shu Chien-Gene Lay 生物工程系和计算机科学与工程系的教授,也是加州大学圣地亚哥分校微生物组创新中心的创始主任。同样在加州大学圣地亚哥分校,Knight 隶属于 Halıcıoğlu 数据科学研究所 (HDSI) 和医学工程研究所 (IEM)。

在 COVID-19 大流行期间,Knight 的团队在建立 SARS-CoV2 病毒废水监测系统方面发挥了关键作用,帮助加州大学圣地亚哥分校校园在 2020 年年中成功安全地重新开放。该系统于 2021 年被圣地亚哥地区全面采用。

在圣地亚哥雷迪儿童医院,奈特担任沃尔夫家族微生物组研究主席,在那里他研究了微生物组在患有囊性纤维化和慢性气道疾病的儿科患者中的作用。

“我们很高兴奈特教授的开创性工作得到了认可,他入选了著名的美国国家工程院,”加州大学圣地亚哥分校校长Pradeep K. Khosla说,他也是美国国家工程院的当选成员。“奈特教授致力于了解生态系统中生物分子、基因组和群落的基本进化,并致力于开发创新工具和技术并与世界各地的科学家分享,以促进进一步的研究,这突显了加州大学圣地亚哥分校教师的素质——以及他们对世界的持续影响。”

portrait of Rob Knight
加州大学圣地亚哥分校教授罗伯·奈特(Rob Knight)当选为美国国家工程院院士。

突破性的微生物组研究

Knight 是微生物组科学研究的领导者,专注于了解这些微生物影响我们日常生活的多种方式,从它们存在于我们体内和身体上,到它们如何与疾病有关,以及它们如何在世界各地的不同生态系统中发挥作用。

他的工作将微生物采样方法与生物信息学和大数据联系起来。奈特帮助揭示了人类肠道微生物组变化与过敏、炎症性肠病、肥胖症和许多其他疾病之间的联系。越来越多的证据表明,肠道微生物也会影响大脑,可能影响情绪、行为和精神疾病。奈特的团队还增强了我们对从海洋到苔原等环境中微生物的理解,并使全球数千名研究人员能够使用高通量测序技术。

在加州大学圣地亚哥分校微生物组创新中心,奈特实验室使用先进的DNA测序和计算技术来分析和了解微生物群落,他们的工作产生了许多最初的软件工具和实验室技术,使微生物组科学成为可能。

“这是一项出乎意料的非凡荣誉,展示了微生物组领域的兴奋和潜力,该领域与生物学、医学和工程学相交,”奈特说。“在微生物组创新中心,我们专注于以对学术界和工业界都有用的方式利用这种潜力,并设计新的用户界面,使微生物组数据对研究人员、临床医生和患者有用且易于访问。”

奈特还是美国肠道项目的联合创始人,该项目旨在通过收集来自世界各地的大量样本来更好地了解生活在我们体内和身体上的微生物组。这是世界上最大的众包公民科学家项目。

“我们在美国肠道项目及其伞式Microsetta倡议方面的经验向我们展示了即使是今天的微生物组数据也可以使公众和研究项目的个人受益,我们目前正在构建下一代工具,以帮助了解微生物组如何影响人类和环境的健康和疾病。“奈特说。

在 COVID 大流行期间,Knight 及其同事迅速构建并部署了一个检测系统,用于监测圣地亚哥 350 座建筑物的废水中是否存在 SARS-CoV2 病毒。该系统经过优化,甚至可以检测出在500多人居住的建筑物中生活和工作的无症状者。建筑物的居住者被通知并建议进行测试。研究小组估计,他们的系统能够及早发现加州大学圣地亚哥分校校园内 85% 的 COVID 病例。在该系统到位之前,检测社区中病毒水平的唯一方法是通过临床试验,这在大规模上是不可行的。

“恭喜你,罗伯!当选美国国家工程院院士标志着对工程师或计算机科学家的最高同行认可。这是一项罕见的荣誉,很少有人能获得,“加州大学圣地亚哥雅各布斯工程学院院长、校长特别顾问、美国国家工程院当选院士Albert P. Pisano说。“对于Rob Knight来说,当选NAE是当之无愧的,也只是故事的一部分。他通过他创建的算法、软件、数据平台和其他工具产生了巨大的影响。它们改变了我们对微生物组的理解。更重要的是,Rob 使用这些工具,以及从中获得的见解和创业机会,以许多不同的方式改善生活。

荣誉和认可

奈特的作品获得了许多赞誉。2019 年,作为美国国立卫生研究院高风险、高回报研究计划的一部分,他获得了先锋奖。他还获得了 2017 年马斯里奖 和 2015 年维尔切克生命科学创意承诺奖。他与他人共同创立了多项公民科学工作,以支持微生物组研究,包括地球微生物组项目和美国肠道项目。他是《Follow Your Gut: The Huge Impact of Tiny Microbes》一书的作者,也是《Dirt is Good: The Advantage of Germs for Your Child’s Developing Immune System》一书的合著者,该书旨在帮助非科学家了解健康微生物组的重要性。

Knight 一直出现在科睿唯安高被引研究人员名单的多个类别中。他还被评为 2023 年引文奖获得者,以表彰他揭示人体复杂微生物生态系统的计算和实验研究。引文奖获得者以发表研究论文而著称,这些论文随后被引用了 2,000 多次。

传记

在加入加州大学圣地亚哥分校之前,奈特是科罗拉多大学博尔德分校的一名教员,在那里他从事的项目包括分析科莫多巨蜥唾液中发现的微生物,以支持保护工作,并了解通过剖腹产或阴道分娩的婴儿的微生物组差异。

奈特在新西兰奥塔哥大学获得生物化学理学学士学位,在普林斯顿大学获得生态学、进化和行为学博士学位。

他加入了 2024 年当选的其他 113 名新 NAE 成员和 21 名国际成员的行列。 NAE 成员超过 2600 人,是成就卓著的工程专业人士,代表了在商业、学术界和政府领域工作的广泛工程学科。

新闻旨在传播有益信息,英文版原文来自https://today.ucsd.edu/story/renowned-uc-san-diego-microbiome-pioneer-rob-knight-elected-to-the-national-academy-of-engineering