她的方法使一种濒危物种’基因组的组装成本不到1000美元
莱斯大学和贝勒医学院今天宣布，基因组学研究人员Olga Dudchenko被麻省理工学院技术评论杂志’s 2019年35岁以下创新者名单提名。Olga Dudchenko的开创性工作使得以不到1000美元的价格重建一个新物种的基因组成为可能。
最初的人类基因组计划花了几十年时间，耗资30多亿美元，确定了一个普通人的DNA字母序列。博士后研究员Dudchenko Rice’s理论生物物理学中心(联合体)和一个博士后基因组中心的架构贝勒医学院,开发了一种方法序列和组装任何生物的基因组或人,类似的质量水平,不到1000美元。
奥尔加·杜先科(Olga Dudchenko)是莱斯大学(Rice University)和贝勒医学院(Baylor College of Medicine)的博士后研究员，她被《麻省理工学院技术评论》(MIT Technology Review)杂志《’s 2019年35岁以下创新者名单》(list of创新者)所收录。(杰夫·菲特洛/莱斯大学)
该中心主任埃雷兹·利伯曼·艾登说，当杜登科6037s方法与DNA测序的最新进展相结合时，使基因组的完整性和准确性在以前是不可能的。她开创性的工作帮助研究人员在2017年抗击寨卡病毒，她后来与人共同创建了DNA动物园(dnazoo.org)，这是一个全球网络，’使用这种方法为60多个濒危和脆弱物种组装基因组。
“我们现在组装基因组的速度比我们在同行评审期刊上发表基因组的速度要快得多，”杜先科最近说。她刚刚结束了在澳大利亚和中国培训合作者使用她开发的基因组组装工具的旅程。在将她的研究方法发表在2017年的《科学》(Science)和2018年的《自然》(Nature)杂志上之后，她有意识地决定让尽可能多的人掌握这些方法。她和基因组结构中心的同事们一起创造了简单易用的工具，不需要在基因组学或数据科学方面受过正式培训。
杜先科说:“我们的方法使基因组组装的问题变得更加抽象、透明和直观。
“ it’有点像玩俄罗斯方块，她在演示软件时说。看看我是怎么移动东西的，把它们放在一起，就像解谜一样。你只需要不断移动这些片段，直到图像开始有视觉上的意义。这时你就知道你的基因组是正确的，”
杜先科说，她和她的博士后导师艾登决定启动DNA动物园项目的原因之一，是为了简化为濒危和濒危物种创建和共享基因组组装的过程。
“Olga是一位了不起的科学家，她的方法对基因组组装产生了革命性的影响。今天，如果不利用她工作中的一些想法，就不可能创造出一流的基因组。
他说，she’组装起来的每一个端到端基因组组合都是其独特故事的开始。例如，她在猎豹研究上的工作已经导致了与猎豹保护团体的合作，利用猎豹基因组学来指导配偶选择。她对花生基因组的研究很可能会加速对农作物增产和抗旱性提高的研究
年度TR35名单表彰了35名年龄在35岁以下的技术人员，他们的突破具有改变世界的巨大潜力。获奖者分为五类:发明家、企业家、梦想家、人道主义者和先驱。杜先科，发明家类别的获奖者，以及2019届的其他成员将在麻省理工学院技术评论w’s 7 / 8月印刷版和杂志’s旗舰会议上出现在9月的马萨诸塞州剑桥。
更多关于过去和现在TR35获奖者和评委的信息请访问www.technologyreview.com/TR35/。
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