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宾夕法尼亚大学新闻

克里特岛生物物理学暑期学校

Eleni Katifori和Arnold Mathijssen在克里特岛度过了一个星期,向宾夕法尼亚大学和其他机构的学生介绍了活跃的生物物理学研究的各种主题和想法。

Photograph of Cretian landscape overlooking a body of water.

八月,来自艺术与科学学院的八名学生与物理与天文学系的Eleni Katifori和Arnold Mathijssen一起参加了克里特岛为期一周的课程,学习生命系统的物理学。

Katifori在促进和组织暑期项目方面发挥了重要作用,来自希腊和美国其他三个机构的教师说:“我们在克里特岛举办的首届暑期学校的目标是提高美国和欧洲学生对国际生物物理学社区的认识,同时为年轻科学家提供促进新合作的环境。

该计划名为“生物物理学:软生命物质”,向四年级本科生和早期研究生(主要来自物理学和材料科学背景)介绍了生物物理学中的前沿研究系统。在七天的时间里,学生和教师参加了一系列讲座、演示、计算研讨会、小组讨论和海报会议。

Mathijssen对生命系统中的流体力学进行了三部分介绍,首先是微小微生物如何在水或大气等流体中移动的基本概念。随后,他解释了生物学中的非平衡扩散,最后是关于活性物质和集体运动的讲座。

Mathijssen说,物理系不再完全涵盖这些基础知识。“通常这些[主题]出现在机械工程课程中,”他说,“有时也出现在数学课程中,所以在考虑一种方法来统一来自世界各地的不同学术背景的一群人的主题时,我认为最好让他们都与基础知识保持一致。

“人们可以忽略这些基础在生物学中的普遍性,”Katifori说。“我们大约70%是流体,流体流动和运输对于保持生物体的生存至关重要。

Aurelia Honerkamp-Smith, Lehigh University; Nikos Hatzakis University of Copenhagen; Eleni Katifori Penn; Emmanouela Filippidi, University of Crete; Dimitris Vavylonis, Lehigh University; Arnold Mathijssen, Penn; and George Gouridis Institute of Molecular Biology and Biotechnology of the Foundation for Research and Technology Hellas.
左起:奥雷利亚·霍纳坎普-史密斯,利哈伊大学;哥本哈根尼科斯·哈扎基斯大学;埃莱妮·卡蒂福里·佩恩;埃马努埃拉·菲利皮迪,克里特大学;迪米特里斯·瓦维洛尼斯,利哈伊大学;阿诺德·马蒂森,宾夕法尼亚州;以及研究与技术基金会的乔治·古里迪斯分子生物学和生物技术研究所。

(图片:由Eleni Katifori提供)

她说,教师们选择的主题旨在填补知识空白,这些空白自然发生在非常广泛的领域,如生物物理学,其中许多专家都专注于其中的一个方面。

物理学和天文学系的博士候选人Georgios Gounaris和Aaron Winn也帮助准备了暑期学校计算生物学研讨会的材料。他们说,一个主要的挑战是让没有编码背景的人可以访问内容,并且仍然令人兴奋和有一定经验的人。

Georgios Gounaris delivering a lecture
“在以阿诺德的Python训练营和物理讲座为基础的研讨会上,我的目标是为学生提供在微观生物运输的复杂世界中的实践经验。我们使用随机游走理论和实验数据来研究生物学相关问题,例如蛋白质的扩散运输和相互作用,Gounaris说。

(图片:由Eleni Katifori提供)

研究疾病空间分布的Winn说,他们的解决方案是让学生选择探索两个主题之一:流行病和实体的随机运动,这个概念被称为随机游走。

“这段经历对我来说特别宝贵,因为我对未来的教学很感兴趣,”Winn说。“但是教授计算生物物理学似乎令人生畏,所以很高兴看到一些学生真正参与到材料中,甚至对未分配的更难的问题感兴趣。

Katifori和Mathijssen说,暑期项目也有助于突出宾夕法尼亚大学学生在国外的机会,同时也为一些欧洲学生提供了新的选择。将来,他们希望能够将该计划提供给更多的学生。

“很高兴看到我的学生很高兴见到全球生物物理学界的成员,并了解欧洲特别是克里特岛所做的工作,”Katifori说。

Eleni Katifori是宾夕法尼亚大学艺术与科学学院物理与天文学系的副教授和本科事务主席。

Arnold Mathijssen是宾夕法尼亚大学艺术与科学学院物理与天文学系的助理教授。

2023 年暑期学校得到了利哈伊大学、宾夕法尼亚大学软物和生命物质中心以及马克斯普朗克学会合作伙伴小组计划的学生和教师的支持。

新闻旨在传播有益信息,英文版原文来自https://penntoday.upenn.edu/news/biophysics-summer-school-crete