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Spies like us: UChicago scientists develop probes made of DNA to track molecular secrets

政府官员被要求保留记录,以便报纸或其他官员可以在事情出错时进行调查——但细胞没有这样的程序。例如,科学家想要了解癌症,就必须拼凑线索并发明工具来了解发生了什么。

细胞产生的一种几乎立即消散的备忘录是一种叫做一氧化氮(NO)的分子。科学家们想要追踪这种分子的运动,因为它在许多疾病中都很重要,尤其是癌症。但到目前为止,找出“不”的唯一方法是将整个细胞切开,然后计算得到的结果——丢失关于这个分子在细胞中何处活动的所有信息。

然而,芝加哥大学的一群化学家宣布了一种创新的系统来“监视”NO在活细胞中的活动。由DNA制成的“突破”探测器在细胞内遇到NO时就会亮起来,这让研究人员能够更好地了解分子的活动,开发药物靶标,并检查药物是否到达了细胞内的预定靶标。

亚穆纳·克里希南教授是一位著名的生物化学家,3月9日在《自然化学生物学》杂志上发表了一篇论文。他说:“这非常令人兴奋,既是了解生物学基本原理的工具,也是改善已经在临床使用的药物的方法。”“这是第一种以亚细胞精度追踪活细胞中分子的方法。”

科学家们知道NOS3——一种产生NO的酶——大部分时间都在细胞的两个主要位置。一个在细胞膜上,另一个在一个叫做高尔基体的看起来像肠道的腔室里,高尔基体负责包裹蛋白质。“NOS3在这两个地点的活动在疾病中是至关重要的,但要判断NOS3在做什么和在哪里是非常具有挑战性的,”该论文的第一作者、芝加哥大学的研究生Maulik Jani说。

这对Krishnan的实验室来说是一个完美的问题,他们的专长是制造微小的传感器,在细胞内移动并报告发生的情况。为了了解从神经元到中性粒细胞等各种细胞的工作原理,他们用dna构建了微型细胞探针——在完成工作后,细胞会无害地溶解这些探针。

研究小组首先用DNA构建了一个包裹,包裹上附着几个分子:一个在NO存在时发光,另一个附着在细胞膜或高尔基体上的“邮寄地址”。为了向另一种基因技术致敬,他们称这种传感器为“NOckout”。

一旦在细胞中释放,NOckout就会前往预定的目的地。每当遇到NO时,荧光警报就会被触发,只要在显微镜下寻找发光的分子,科学家就能看到细胞中NO的生成位置和数量。

科学家们对它的意义感到兴奋。该工具可以帮助追踪NOS酶在癌症、心脏病和神经退行性疾病等方面的异常情况。贾尼说:“但你并不总是知道这种疾病是由于生产太多还是太少。”


克里希南说:“如果你已经有了一种药物,这就为你提供了一种方法,来跟踪你的药物是否真的像你认为的那样发挥作用,而这往往是药物研究中所缺少的,也是非常宝贵的。”

贾尼说,除了细胞膜和高尔基体,他们已经有了可以发送探测器到其他5个重要细胞器的邮寄地址。它也可以用于其他难以追踪的分子,这些分子扮演着重要但神秘的细胞角色。

“NO是一种反应性很强的分子,它能与遇到的任何物质发生反应,所以很难捕捉到它。”还有很多像NO这样的分子,这种方法可能对追踪它们很有用,”Jani说。

这篇论文的其他合著者是研究生周俊义和博士后研究员阿涅什·维提尔。

引文:“基于dna的荧光探针以亚细胞空间分辨率绘制NOS3活动。贾妮等,《自然化学生物学》,2020年3月9日,https://doi.org/10.1038/s41589-020-0491-3

资助:宾夕法尼亚大学孤儿疾病中心、安德鲁·科波拉基金会、芝加哥大学妇女委员会、国家糖尿病、消化和肾脏疾病研究所、芝加哥生物医学协会、芝加哥社区信托基金的塞尔基金、大脑研究基金会、梅格尔·芬斯基奖。

新闻旨在传播有益信息,英文原版地址:https://news.uchicago.edu/story/spies-us-uchicago-scientists-develop-probes-made-dna-track-molecular-secrets