罗格斯大学的蛋白质数据银行获得了3450万美元的赠款

麻疹病毒中的六种蛋白质共同作用来感染细胞。图片:David S. Goodsell高分辨率

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Todd Bates
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总部设在罗格斯大学-新不伦瑞克分校的RCSB蛋白质数据库五年内从美国三个政府机构获得了3450万美元的资助。

这笔资金——比前一个五年期间增加了约5%——用于正在进行的操作,并将扩大世界上唯一开放获取的、用于三维生物分子结构的数字数据资源的覆盖面。

该数据库自1998年起设在罗格斯大学,计划利用增加的新资金加强对研究人员、学术机构、营利性公司和公众的服务。这些运营拨款来自国家科学基金会、美国能源部、国家癌症研究所、国家过敏和传染病研究所以及国家卫生研究院下属的国家普通医学科学研究所。

“这些赠款是至关重要的和非常感激因为蛋白质数据银行过程中扮演着重要的角色在救命药物的发现,生物和医学基础研究与应用研究和专利申请大学以及生物制药和生物技术公司,”首席研究员斯蒂芬·k·伯利说,大学教授和亨利·罗格斯大学的椅子上,他的数据银行和定量生物医学研究所。“这是一项具有深远影响的公益事业,我们计划用新的资金帮助迎来结构生物学的新黄金时代。”

蛋白质数据库档案库收藏了超过15万个蛋白质、DNA和RNA的3D结构,这些结构在全世界都可以免费获得。该档案由全球蛋白质数据库伙伴关系共同管理,涉及美国、欧洲和亚洲的数据中心。RCSB在美国的业务由罗格斯大学、加州大学圣地亚哥分校、圣地亚哥超级计算机中心和加州大学旧金山分校的蛋白质数据库领导。

海伦·m·伯曼(Helen M. Berman)是罗格斯-新不伦瑞克大学理事会杰出的化学和化学生物学荣誉教授,1971年与人共同创建了该数据库,1998年将其引入罗格斯大学,并领导该组织直到2014年。

蛋白在所有生物体中起重要作用。它们特定的氨基酸序列赋予了蛋白质独特的形状和化学特性。蛋白质依赖于对特定三维分子形状的识别,从而在防御、运输、酶、结构、储存和通信等方面发挥正确的功能。这些蛋白质的形状和功能在这幅拼贴画中被强调。图片:Maria Voigt High Res数据库正以每年近10%的速度增长,并被全球数百万人使用。研究人员、教育工作者、学生、公民、医疗专业人员、患者、患者维权人士以及生物制药和生物技术公司每天下载近200万个分子结构数据文件。

在农业、基础生物学和动物学、生物医学、计算机科学、数学、物理科学、材料科学、生物医学工程、生物能源和可再生能源领域工作的个人可以从这些免费提供的数据中获益。复制数据库档案的内容估计要花费150亿美元。

罗格斯大学的专家生物策展人小组审查存入数据库的每一个新结构,一个跨州的软件开发团队构建工具。计划中的增强包括改进数据库结构的质量和扩展它们在科学领域的可用性。

罗格斯大学还拥有一个外联/教育团队,开发获奖插图和视频以及课程和其他教育材料。每年有超过60万人访问该数据库的教育和推广网站。

新闻旨在传播有益信息,英文原版地址:https://news.rutgers.edu/protein-data-bank-rutgers-awarded-345-million-grant/20191031