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新工具有助于发现癌症传播的基因罪魁祸首

耶鲁大学Pop art-style illustration of cancerous lungs. 研究人员开发了一种新方法,可以同时研究数百种突变组合,以了解它们驱动肺转移的能力。

癌症能够在身体的远处形成转移,这一能力导致90%的人死于实体肿瘤。转移是复杂的基因相互作用的结果,科学家们很难对其进行研究。4月8日,耶鲁大学的研究人员在《自然方法》(Nature Methods)杂志上发表报告称,他们已经设计出一种方法来识别其中一些最危险的相互作用。

“转移是一个复杂的过程;这篇论文的资深作者、遗传学助理教授Sidi Chen说。“有成千上万种潜在的基因相互作用,很难知道哪些是最重要的。”

利用CRISPR基因编辑技术,研究人员创建了一个包含近1.2万个独特结构(DNA可以敲除细胞中的基因)的文库,目标是325对与人类癌症转移有关的基因。他们发现,其中几对突变基因导致小鼠肿瘤的侵略性扩散。

“通过我们的方法,我们能够确定驱动转移的特定突变组合,”三年级医学博士Ryan Chow说。学生,本研究的第一作者之一。“这是理解癌症进展背后的复杂基因相互作用的重要一步。”

作者说,这项技术有一天可能使科学家能够研究从个别病人身上发现的转移相关基因的组合,甚至可以同时分析其中三到四个基因之间的相互作用。他们指出,最终,理解这些基因间的相互作用可能会帮助科学家设计出新的策略来阻止各种不同癌症的扩散。

耶鲁大学的周广川、王广川和叶鲁鹏是这项研究的共同第一作者。

陈隶属于耶鲁大学遗传学系、耶鲁大学癌症中心、耶鲁大学干细胞中心、系统生物学研究所和西校区癌症系统生物学中心。

这项研究的主要资金来自美国国立卫生研究院。

陈的实验室还获得了其他机构的资助,如国防部、美国癌症研究协会、癌症研究所、达蒙·鲁尼恩、黑色素瘤研究联盟、圣·鲍德里克基金会、乳腺癌联盟、玫琳凯基金会、V基金会、路德维希家庭基金会、桑塔格基金会和切尼维特家庭基金会。